过敏性咳嗽和咳嗽变异性哮喘的临床症状比较相似，如油烟、灰尘、冷空气等外界因素，容易诱发明显的刺激性咳嗽，许多患者将这两种疾病混淆。 其实，这两种病有区别。 两者最大的不同在于，过敏性咳嗽只是咳嗽感受器敏感性增加，病变通常不累计气管支气管，咳嗽剧烈，但气道反应性往往不高，为肺功能通常是正常的。
而与咳嗽变异性哮喘不同，咳嗽变异性哮喘的本质仍然是哮喘，也可能是轻度哮喘，病变累及气管、支气管，为肺功能检查会有异常，气道反应明显升高，咳嗽时气促因此，它们的主要区别在于是否存在气道高反应性，是否影响肺功能。
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